Biofyzikalni laborator @UFKL - Biophysics @Dept. Condensed Matter Physics

Program Semináře biofyziky a biofyzikální chemie a NCBR F7790 a CB061

Biofyzikalni laborator @UFKL

Semináře CC060, C8010 a F7790 se v jarním semestru 2023 konají v níže uvedených datech od 14.00 do 16.00 v místnosti 205 budovy B11 na Univerzitním kampusu Bohunice (UKB).

Obecná doporučení, jak se chovat (nejen) na semináři:
General recommendations how to behave (not only) during the seminar:

All I Really Need To Know I Learned In Kindergarten by Robert Fulghum:

ALL I REALLY NEED TO KNOW about how to live and what to do and how to be I learned in kindergarten. Wisdom was not at the top of the graduate-school mountain, but there in the sandpile at Sunday School. These are the things I learned:

Share everything.
Play fair.
Don't hit people.
Put things back where you found them. Clean up your own mess.
Don't take things that aren't yours.
Say you're sorry when you hurt somebody. Wash your hands before you eat.
Flush.
Warm cookies and cold milk are good for you.
Live a balanced life - learn some and think some and draw and paint and sing and dance and play and work every day some.
Take a nap every afternoon.
When you go out into the world, watch out for traffic, hold hands, and stick together.
Be aware of wonder.
Remember the little seed in the styrofoam cup: The roots go down and the plant goes up and nobody really knows how or why, but we are all like that. Goldfish and hamsters and white mice and even the little seed in the Styrofoam cup - they all die.
So do we.
And then remember the Dick-and-Jane books and the first word you learned - the biggest word of all - LOOK.
Everything you need to know is in there somewhere. The Golden Rule and love and basic sanitation. Ecology and politics and equality and sane living.
Take any of those items and extrapolate it into sophisticated adult terms and apply it to your family life or your work or your government or your world and it holds true and clear and firm.
Think what a better world it would be if all - the whole world - had cookies and milk about three o'clock every afternoon and then lay down with our blankies for a nap. Or if all governments had a basic policy to always put thing back where they found them and to clean up their own mess.
And it is still true, no matter how old you are - when you go out into the world, it is best to hold hands and stick together.

Robert Fulghum: Všechno, co opravdu potřebuju znát, jsem se naučil v mateřské školce

VŠECHNO, CO OPRAVDU POTŘEBUJU ZNÁT o tom, jak žít, co dělat a jak vůbec být, jsem se naučil v mateřské školce. Moudrost mě nečekala na vrcholu hory zvané postgraduál, ale na pískovišti v nedělní škole. Tohle jsem se tam naučil:
O všechno se rozděl.
Hraj fér.
Nikoho nebij.
Vracej věci tam, kde jsi je našel.
Uklízej po sobě.
Neber si nic, co ti nepatří.
Když někomu ublížíš, řekni promiň.
Před jídlem si umyj ruce.
Splachuj.
Teplé koláčky a studené mléko ti udělají dobře.
Žij vyrovnaně – trochu se uč a trochu přemýšlej a každý den trochu maluj a kresli a zpívej a tancuj a hraj si a pracuj.
Každý den odpoledne si zdřímni.
Když vyrazíš do světa, dávej pozor na auta, chytni někoho za ruku a drž se s ostatními pohromadě.
Nepřestávej žasnout. Vzpomeň si na semínko v plastikovém kelímku – kořínky míří dolů a rostlinka stoupá vzhůru a nikdo vlastně neví jak a proč, ale my všichni jsme takoví.
Zlaté rybičky, křečci a bílé myšky a dokonce i to semínko v kelímku – všichni umřou. My také.
A nikdy nezapomeň na dětské obrázkové knížky a první slovo, které ses naučil – největší slovo ze všech – DÍVEJ SE.
Všechno, co potřebujete znát, tam někde je. Slušnost, láska a základy hygieny. Ekologie, politika, rovnost a rozumný život.
Vyberte si kterékoliv z těch pravidel a řekněte to složitými dospělými výrazy a vztáhněte si na to svůj život v rodině nebo práci, na svou vládu nebo svůj svět a uvidíte, že to platí, je to jasné a sedí to. A představte si, oč lepší by byl svět, kdybychom si všichni – na celém světě – každý den ve tři odpoledne dali koláček a mléko a pak si lehli a zdřímli si s polštářkem pod hlavou. Nebo kdyby základní politikou všech vlád bylo vždycky vracet věci nazpátek a uklízet po sobě.
A stále ještě platí – bez ohledu na to, kolik vám je let -, že když vyrazíte do světa, nejlepší je chytit někoho za ruku a držet se pohromadě.

As of attendance: MU study and examination regulations Section 9, paragraph 2: Full-time students are required to attend teaching activities with the exception of lectures and consultations.
Paragraph 6: A student has the right to a minimum of one unexcused absence per semester from compulsory teaching activities in a given course; this does not apply to intensive courses or specially scheduled courses (section 9, subsection 4). In case a student utilizes the right described in the first sentence, he/she must meet in-term assessment requirements or other conditions associated with teaching activities in a given course, if so prescribed. A higher number of absences may be stipulated by the teacher if so permitted by teaching and study-related conditions.
Paragraph 7: A student is obliged to provide a written excuse letter to the faculty Office for Studies justifying his/her absence within five workdays of the teaching activity he/she was absent from.

Na téma docházky: Studijní a zkušební řád Masarykovy univerzity Čl. 9, odst. 2: Účast ve výuce je pro studenty prezenční formy studia povinná s výjimkou přednášek a konzultací.
Čl. 9, odst. 6: Studenti mají během jednoho semestru právo na minimálně jednu neomluvenou absenci v povinné výuce daného předmětu; toto neplatí v případě předmětů, které vyžadují blokovou výuku nebo výuku se zvláštním časovým průběhem (čl. 9 odst. 4). Pokud student využije právo uvedené ve větě první, musí splnit požadavky průběžných kontrol nebo jiné podmínky výuky předmětu, pokud jsou pro daný předmět předepsány. Vyučující může stanovit i vyšší počet absencí, pokud to umožňují podmínky výuky a studia daného předmětu.
Čl. 9, odst. 7: Student je povinen písemně omluvit na studijním oddělení fakulty svou neúčast do 5 pracovních dnů od termínu konání výuky, jež je omlouvána.

Prezentace by měly splňovat následující kriteria:
The presentations should follow these criterions:

neměly by být kratší 20 minut a delší 30 minut
shouldn't be shorter 20 minutes and longer 30 minutes
měly by být srozumitelné širšímu vědeckému publiku
should be comprehensible to wider audience
měly by obsahovat:
should include:
- stručné představení přednášejícího
  short intro of the presenter (the host of the seminar - Žídek / Kubíček - will also introduce the presenter before the presentation)
- úvod do problematiky
  Introduction
- popis problému, způsob jeho řešení a cíle
  Description of the problem, aims of the study and your approach to solve your project
- výsledky
  Results
- závěr
  Conclusion
jsou vedeny v anglickém jazyce
by default, all lectures are in English
přednášející se dostaví v dostatečném předstihu před zahájením semináře a zkontroluje, že veškerá audiovizuální technika funguje a je kompatibilní s připravenou přednáškou
the presenter is responsible for checking the room and AV-devices being compatible with her/his presentation and make sure that everything is ready to start on time

To book your seminar, select available slots: Doodle planning
The doodle planning is to ease planning, provide flexibility and aviod overlaps during the time when the organizers of the seminars do not have access to computer. The selected slots will be then confirmed and listed below.

1	Thursday Feb 16	SPEAKER: Lukáš Žídek, Richar Štefl, Pavel Plevka TOPIC: Introductory seminar, CIISB meeting	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
2	Thursday Feb 23	SPEAKER: Karel Kubíček TOPIC: Scientific writing, typography	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
3	Thursday Mar 2	SPEAKER: Petr Kulhánek TOPIC: AlphaFold / AlphaPullDown	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
4	Thursday Mar 9	SPEAKER: Richard Štefl TOPIC: Phase separation in biology: the concept & misconceptions	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
5	Thursday Mar 16	SPEAKER: iří Marek / Marika Hrubá TOPIC: Open data/FAIR data	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
6	Thursday 23	SPEAKER: No seminar on this day TOPIC: XIX Discussions in Structural Molecular Biology in Nové Hrady	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
7	Thursday Mar 30	SPEAKER: Gabriel Demo TOPIC: Ribosome structure and function	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
8	Thursday Apr 6	SPEAKER:No seminar on this day TOPIC: Easter	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
9	Thursday Apr 13	SPEAKER: PhD candidate TOPIC: PhD defence	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
10	Thursday Apr 20	SPEAKER: Konstantinos Tripsianes TOPIC: (auto)phosphorylation mechanisms by NMR	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
11	Thursday Apr 27	SPEAKER: Lukáš Trantírek TOPIC: in-cell NMR: drug profiling, molecular target structure validation	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
12	Thursday May 4	SPEAKER: students TOPIC: students' projects	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
13	Thursday May 11	SPEAKER: rector's day off TOPIC: MUNI day	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.
14	Thursday May 18	SPEAKER: students TOPIC: students' presentations	WHERE: B11 / 205 WHEN: @2PM s.t.